Nguyên nhân viêm kết mạc ở trẻ sơ sinh có thể là:
- Do phản ứng với thuốc nhỏ mắt dự phòng: biểu hiện trong 12–24 giờ sau khi nhỏ thuốc.
- Do nhiễm lậu: biểu hiện 2–5 ngày sau sinh, thường được dự phòng bằng thuốc nhỏ mắt.
- Do nhiễm chlamydia: biểu hiện 5–14 ngày sau sinh, thường không thể dự phòng bằng bằng thuốc nhỏ mắt.